Der Zweck der Stiftung ist es, laufende Forschungsprogramme zu unterstützen und voranzutreiben. Jegliche Mittel, die die Stiftung erhält, sind für aussichtsreiche neue Forschungsprogramme sowie die Weiterentwicklung bereits laufender Forschungsprojekte bestimmt.

Die Stiftung kann alle Personen, Stiftungen innerhalb und ausserhalb der Schweiz, Organisationen, Firmen oder Institutionen ansprechen, die ihr bei der Erfüllung des Zwecks dienlich sind. Sie hat auch die Möglichkeit, Paten zu ernennen.

An die Schweizer Behörden wurde ein Antrag gestellt, die Stiftung als gemeinnützig anzuerkennen und sie daher von jeglicher Steuer zu befreien (dies ist ein spezieller Status, der Vereinen verliehen wird, die anerkanntermassen zum Gemeinwohl beitragen). Wenn der Antrag genehmigt wird, ist die Stiftung nicht nur von der Steuer freigestellt, sondern dann können geleistete Spenden auch von der Steuer abgesetzt werden (dies gilt zumindest in der Schweiz, jedoch nicht zwangsläufig für Spenden aus anderen Ländern).

In jedem Fall unterliegt die Stiftung, aufgrund ihrer Ziele, der Aufsicht des Eidgenössischen Departements des Innern.

Die Loterie Romande hat diese Webseite (www.foundation-sanfilippo.ch) finanziert. Die Stiftung finanziert sich über private Spenden sowie Spenden von Firmen und wohltätigen Organisationen.